Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
ATP1A4Q13733 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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