Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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TRAF1Q13077 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRAF1Q13077 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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