Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPN13Q12923 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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