Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SORBS1-202ENST00000306402 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ARPP21-204ENST00000412048 2506 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PDE4DQ08499 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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