Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CHRNEQ04844 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms