Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CENPFP49454 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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CENPFP49454 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
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CENPFP49454 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CENPFP49454 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CENPFP49454 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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CENPFP49454 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CENPFP49454 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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