Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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USP18Q9UMW8 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
USP18Q9UMW8 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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