Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
PDGFDQ9GZP0 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PDGFDQ9GZP0 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms