Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FHL3Q13643 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms