Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PTCH1Q13635 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTCH1Q13635 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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