Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC097634.1-201ENST00000604491 2467 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCOF1Q13428 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCOF1Q13428 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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TCOF1Q13428 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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TCOF1Q13428 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TCOF1Q13428 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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