Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL450327.1-201ENST00000430931 2632 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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CLN3Q13286 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 TMBIM6-202ENST00000395006 2598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 RPL6-202ENST00000424576 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
CLN3Q13286 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
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