Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF2Q12947 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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