Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms