Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
HOXD10P28358 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXD10P28358 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms