Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 LRRC36-205ENST00000563189 2104 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
GRIK4Q16099 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms