Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ZNF56Q15929 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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ZNF56Q15929 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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ZNF56Q15929 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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ZNF56Q15929 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF56Q15929 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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