Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
USF2Q15853 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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