Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MR1-209ENST00000617803 7584 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
RYR3Q15413 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms