Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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