Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXD4Q12950 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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FOXD4Q12950 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FOXD4Q12950 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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