Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms