Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPS29P62273 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 MORF4L1P4-201ENST00000450245 976 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPS29P62273 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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