Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PGGT1BP53609 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PGGT1BP53609 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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