Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
ACADSBP45954 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms