Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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PTPRBP23467 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRBP23467 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRBP23467 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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