Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
HOXD8P13378 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
HOXD8P13378 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms