Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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USP29Q9HBJ7 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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USP29Q9HBJ7 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
USP29Q9HBJ7 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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