Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GTF3C6Q969F1 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms