Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
COL24A1Q17RW2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
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COL24A1Q17RW2 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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COL24A1Q17RW2 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
COL24A1Q17RW2 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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