Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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SS18Q15532 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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