Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CACNA1SQ13698 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CACNA1SQ13698 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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