Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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SGCGQ13326 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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