Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SEMA3BQ13214 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms