Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1BQ13112 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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