Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ODF2-205ENST00000393527 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
PTPRAP18433 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
PTPRAP18433 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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