Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SALL3Q9BXA9 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms