Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CDCA8Q53HL2 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
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