Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CTXN3Q4LDR2 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CTXN3Q4LDR2 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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