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| CTXN3 | Q4LDR2 | ABCA12-201 | ENST00000272895 | 9100 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNF133-201 | ENST00000340112 | 1445 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CASC19-206 | ENST00000641028 | 1430 nt | BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KIF21A-201 | ENST00000361418 | 5044 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | POU2F1-212 | ENST00000541643 | 13937 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | LINC01619-203 | ENST00000549802 | 2169 nt | TSL 2 BASIC | 4.97 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ARHGAP28-207 | ENST00000532996 | 1859 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC000367.1-201 | ENST00000452711 | 1766 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | PEAK1-204 | ENST00000560626 | 19217 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CASC1-202 | ENST00000354189 | 2445 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.61 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | KLHL13-201 | ENST00000262820 | 3972 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AASDH-201 | ENST00000205214 | 3590 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MTND4P10-201 | ENST00000446199 | 1363 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | OR1L3-201 | ENST00000304820 | 1118 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | U3.22-201 | ENST00000391120 | 215 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | RFPL4AP5-201 | ENST00000514977 | 504 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC011853.2-201 | ENST00000526901 | 774 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SAMD15-202 | ENST00000533095 | 412 nt | TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | NAV2-AS3-201 | ENST00000534036 | 598 nt | TSL 3 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC7-209 | ENST00000539197 | 581 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC103808.1-201 | ENST00000579833 | 922 nt | TSL 3 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC015804.1-201 | ENST00000622935 | 435 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359757.1-201 | ENST00000623176 | 255 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR6C3-203 | ENST00000641740 | 1093 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | DLX6-AS1-201 | ENST00000430027 | 15364 nt | TSL 2 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AFM-201 | ENST00000226355 | 2059 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GBE1-205 | ENST00000489715 | 2513 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MUC12-202 | ENST00000379442 | 16737 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | FNIP1-201 | ENST00000307954 | 6366 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | TECRL-201 | ENST00000381210 | 3573 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | C17orf78-204 | ENST00000615133 | 1862 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | SGO1P1-201 | ENST00000603525 | 1447 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR14L1P-202 | ENST00000641545 | 3009 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AC108751.5-201 | ENST00000492880 | 1336 nt | BASIC | 4.96 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR8H2-203 | ENST00000641311 | 3092 nt | APPRIS P2 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | ZNF334-203 | ENST00000593880 | 2635 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EYA1-205 | ENST00000388742 | 3907 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | NFE2L2-204 | ENST00000423513 | 1382 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNA5SP447-201 | ENST00000363749 | 119 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | MIR16-1-201 | ENST00000385271 | 89 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC5P-201 | ENST00000388104 | 126 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL079342.2-201 | ENST00000403367 | 482 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AL136310.1-201 | ENST00000404926 | 654 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | GLS-204 | ENST00000409428 | 816 nt | TSL 2 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | EIF4A1P3-201 | ENST00000411521 | 244 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR4K6P-201 | ENST00000416478 | 897 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AL159174.1-202 | ENST00000425588 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AL359878.2-201 | ENST00000435531 | 407 nt | TSL 3 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | RNU6ATAC28P-201 | ENST00000459249 | 118 nt | BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | OR52Z1-201 | ENST00000510471 | 897 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
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| CTXN3 | Q4LDR2 | AP002004.1-202 | ENST00000528437 | 586 nt | TSL 2 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AP003969.1-201 | ENST00000531846 | 400 nt | TSL 2 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC7-207 | ENST00000535327 | 700 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | CCDC7-208 | ENST00000537047 | 657 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |
| CTXN3 | Q4LDR2 | AC073864.1-201 | ENST00000540161 | 562 nt | TSL 4 BASIC | 4.95 | □□□□□ -1.62 | | |