Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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BBS9Q3SYG4 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BBS9Q3SYG4 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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