Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CDKN3Q16667 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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