Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SGCBQ16585 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SGCBQ16585 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms