Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FXNP1-201ENST00000555153 337 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 HAVCR1-204ENST00000522693 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PRICKLE1-202ENST00000445766 4075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CCDC85BQ15834 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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