Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
CHD4Q14839 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHD4Q14839 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms