Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
DDX39BQ13838 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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DDX39BQ13838 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
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DDX39BQ13838 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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DDX39BQ13838 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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DDX39BQ13838 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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DDX39BQ13838 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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DDX39BQ13838 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
DDX39BQ13838 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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