Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ALCAMQ13740 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ALCAMQ13740 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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