Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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