Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CHAF1AQ13111 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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