Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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FOXD4Q12950 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
FOXD4Q12950 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
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