Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
LMAN2Q12907 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms